其中仪器控制模块包括了用于仪器自动化控制的指令，成像设备 (扫描振镜、压电控制台、步进电机控制台)，激光启动器 (激光强度、激光调制) 和显微镜控制。
其中成像模块可用于获取、处理和显示图像，使得用户可以读取单点数据 (强度、动力学、偏振、寿命)，行数据和图像。用户界面包括了获取参数设定 (像素停留时间、图像大小和分辨率) 和图像类别选择 (偏振、荧光寿命成像 (FLIM)、N&B、RICS)。图像堆栈是在不同轴方向 (XYZ，XZY)，以及时间序列 (t, Xt, XYt, XZt) 中获取的。
FLIM图像是用两个模式中的一个获取的，要么是频域 (DFD) 技术，要么是时域 (TCSPC) 技术。FLIM数据会通过最小化技术 (Marquardt-Levenberg算法) 和相位图进行处理。当有多个组成部分出现时，数据会以寿命图像、指数前因子图像和分数贡献图像的形式被呈现。
软件包括了图像间的运作、图像平滑、过滤、旋转、缩放和用于图像对比增强的自动阈值设定。图片可以导出为ImageJ，并且图表可以导出为各种常见格式 (png、jpeg、gif、tiff、bitmap、metafile)。影片是以avi的格式制作的。
其中FFS模块包括了FFS (FCS, FCCS, PCH, 扫描FCS, RICS, N&B) 数据获取的例行程序。数据分析是用自相关函数 (FCS) 、互相关函数 (FCCS) 或光子计数直方图实现的。
用户可以生成自定义模型函数并让用于单点FCS的软件进行拟合。多个文件可以用全局分析和自相关函数或光子计数直方图中的一个进行分析。图表可以被导出为各种常见格式 (png、jpeg、gif、tiff、bitmap、metafile)。
其中smFRET模块包括了专门为成对分子荧光共振能量转移 (FRET) 测定、猝发分析和反聚束而设计的例行程序。单分子FRET数据可以被分析，用于揭示长时间下的单分子事件。例如说，在10分钟至数小时内，对单分子事件进行计数，测定FRET效率，并计算FRET对的距离分布。拟合算法使用了最大似然估计器来寻找与光子从供体至受体抵达时间相关的拟合参数。
其中粒子追踪模块使得媒介中粒子轨迹的重建成为可能。
Product Specifications for VistaVision
仪器控制模块
- 扫描振镜扫描率的控制；滑台参数；激光强度和激活。
图像获取
- 选择像素滞留时间、图像大小、图像分辨率
图像处理
- 图像间的运算、平滑、滤波、对比度增强处理
FLIM处理
- 寿命拟合 (Marquardt-Levenberg算法)
- 相位图
FLIM显示
- 寿命图像
- 百分比贡献图像
- 指数前因子图像
绘图导出模式
- gif, tiff, jpeg, png, bmp, metafile
影片导出格式
- avi
FFS模块分析
- FCS, PCH, FCCS的拟合模型提供了
- 扩散系数、浓度、流速、激发体积大小
- 上至120个文件的全局分析拟合
- 用户定义的等式分析
smFRET模块
- 分子对FRET测定
- 突发分析
- 用到最大似然估计的拟合算法
仪器控制模块
VistaVision配置文件允许用户选择合适的驱动器用于各种组件
数据采集卡
扫描镜模块
- ISS扫描镜模块
- Cambridge Technology型号
压电控制滑台
- ISS XYZ压电控制滑台
- MadCity Nanoposition型号
- PI PiezoNano型号
- Nanomotion, SC-AT型号
自动显微镜
- 尼康TE2000-E, Ti-E型号
显微镜载物台
- ASI 2000型号
- Prior Scientific H117P2IX型号
激光发射器
- ISS激光发射器系列
- 用于钛宝石激光器的强度控制单元
Two-detector unit
- 包括了两个快门、两个滤光轮和一个二向色轮的探测器单元，用于LSM升级套件 (奥林巴斯, Leica, 尼康, Zeiss)
成像模块
数据采集
单位点测量
- 强度
- 偏振
- 动力学
- 寿命
行测量
- 行采集
- 轮廓采集
稳态图像 (单平面和层扫)
- 偏振
- 比例法
- 动力学
- 延时录制
FLIM图像(数字频域) (单平面和层扫)
- 在数字频域 (DFD) 中获取。 该程式同时采集FLIM图像和稳态图像。
FLIM图像时域 (单平面和层扫)
- 在时间相关单光子计数 (TCSPC) 中获取
光栅图像相关光谱 (RICS)
- 激光光束获取的图像拥有适合分子动力学分辨的驻留时间。该技术用于从荧光共焦图像中测量分子动力学和浓度。
扫描FCS (需要FFS模块)
- 激光光束以直径100 - 200 nm (用户决定) 的圆旋转，并且FFS数据是在特定角度获取的。在每一个角度，一个FCS曲线会被重新构造。
数量和亮度 (N&B)
- 激光光束以适合获取局部波动的滞留时间获取图像。测量结果显示了团簇和单体/二聚体的存在。
图像采集 (光栅扫描)
最小滞留时间
- 0.2 µs
像素数量
- 对于稳态图像：用户能在2到4096间选择
- 对于FLIM图像：用户能在2到2048之间选择
最大行频
- 12 KHz (20个位点)
最小行频
- 0.01 Hz
最大帧率
- 512 x和nbsp;512: 1 s
光束停留
- 光束可以被停留在任何位置以获取FFS数据
扫描模式
- 对于动力学研究：t, Xt, XYt, XZt, XYZt, XZt
- 对于光学切片：XZ, XYZ
图像处理和分析
图像操作
- 图形缩放
- 图像运算
- 平滑处理
- 视图缩放
- 旋转
FLIM处理
- 最小化技术 (Marquardt-Levenberg算法)
- 相位图
FLIM显示
- 寿命图像
- 分数贡献图像
- 指前因子图像
FLIM图像 (数字频域) (单平面和层扫)
- 在数字频域中获取 (DFD). 该程式同时采集FLIM图像和稳态图像。
图像导出格式
- ImageJ
绘图导出格式
- gif, tiff, jpeg, png, bmp, metafile
影像导出格式
- avi
Data File Formats
ifi - 32位浮点
- 共焦图像 (稳态)
- 文件标题包括了：图像尺寸、像素时间、强度等等
ifli - 32比特浮点
- DFD (FastFLIM)
- AFD (analog FD)
- 包括了：DC、相位、G, S.
- 文件标题包括了：图像尺寸、像素时间、强度等等
- 文件已经根据参考文件修正
fbd - 原始数据 (FIFO)
- DFD (FastFLIM)
- 数据没有被修正。
- 该文件自动以 .ifli格式文件保存。不储存标题、图像大小和像素时间
fbs - 试验信息
- fbd格式的标题
- 文件标题包括了：图像尺寸、滞留时间以及填充信息
spc - 原始数据 (FIFO)
- TTTR，时间标记时间分辨
- 与TCSPC一同使用
set - 实验信息
- spc格式的标题
- 文件标题包括了：图像尺寸、滞留时间以及填充信息
tif - TIFF标记图像文件格式
- 共焦图像 (稳态)
bin - 二进制16比特
- LFD图像文件或时间模式中的FCS
- 共焦图像 (稳态)
- RICS
int - 32比特浮点
- LFD图像文件
ref - LFD ref文件
- DFD (FastFLIM), 256 x 256像素
- 已经根据参考文件做过修正
支持的数据文件格式
ref - LFD参考文件
- DFD (FastFLIM)，256 x 256像素
- 已经根据参考文件做过修正
spc - 用于原始数据的B&H格式 (FIFO)
- TTTR，时间标记时间分辨
- 与TCSPC一起使用
set - 用于实验信息的B&H格式
- spc格式的标题
- 文件标题包括了：图像尺寸、滞留时间以及填充信息
FFS模块
数据采集
自相关 (FCS)
- FCS函数提供了波动的时间相关性。
互相关 (FCCS)
- 对于在两个或三个通道上同时发生的事件，FCCS函数提供了其有关的波动时间相关性。
光子计数直方图 (PCH)
- PCH函数绘制了波动振幅的分布。
在图像中目标XYZ位置的FFS测量
- 用户通过移动光标或者在软件中输入值以选择XYZ位置。激光光束依次移动到每一个位置以采集将要被分析的FFS数据。
FLCS，荧光寿命相关光谱仪
- 使用寿命数据 (TCSPC或是频域)，该技术能分离来自不同FCS的贡献。
扫描FCS (需要FFS模块)
- 激光光束会在直径100 - 200 nm (由用户决定) 的圆上旋转，并且FFS数据会在特定的角度被采集。在每一个角度FCS曲线都会被重建
数据分析
| 单个数组和全局拟合模型 | 参数测定 |
|---|---|
| 自相关 (FCS) 和互相关 (FCCS) | |
|
|
| 光子计数直方图 (PCH) | |
|
|
| 用户定义的等式 | |
|
|
数据文件格式
fcs - 二进制格式
- FFS原始数据文件
csv - ASCII格式
- FCS
- 相关和自相关函数
hst - ASCII格式t (csv)
- PCH - 光子计数直方图
nts - 文本文件
- 关于FFS文件的注释
数据采集
记录单光子事件
- 从0上至小时
数据分析
测定FRET对的距离分布和FRET效率
- 拟合算法用到了最大拟然估计
